24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1896 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1896  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 217 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.609577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.53 
 
 		 1343 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.97 
 
 		 958 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.71 
 
 		 510 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  31.45 
 
 		 501 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1094 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.2 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.62 
 
 		 302 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  32.53 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.22 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.56 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  34.15 
 
 		 493 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  37.12 
 
 		 1194 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  32.05 
 
 		 546 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.63 
 
 		 323 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.46 
 
 		 1139 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4513  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.18 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.283819  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.72 
 
 		 220 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.72 
 
 		 220 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 		 1181 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  39.33 
 
 		 374 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  28.81 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>