18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1882 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1882  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  747    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0470  hypothetical protein  30.16 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.634716  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3450  hypothetical protein  25.18 
 
 		 353 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13215  hypothetical protein  27.1 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.574528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4112  hypothetical protein  27.46 
 
 		 427 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3800  hypothetical protein  24.73 
 
 		 495 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0830819  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4656  hypothetical protein  26.95 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07630  hypothetical protein  25.78 
 
 		 470 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3731  hypothetical protein  27.32 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1812  hypothetical protein  26.04 
 
 		 465 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1525  hypothetical protein  26.87 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12687  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1467  hypothetical protein  24.05 
 
 		 463 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.878359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0300  hypothetical protein  26.07 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0201  hypothetical protein  27.78 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.93878  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1190  hypothetical protein  26.62 
 
 		 493 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1431  hypothetical protein  23.46 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1413  hypothetical protein  23.46 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0699  hypothetical protein  28.51 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>