22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1769 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1769  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  666    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  26.85 
 
 
435 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  27.11 
 
 
446 aa  52.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  25.3 
 
 
441 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  25.6 
 
 
440 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  23.67 
 
 
441 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  24.23 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  25.37 
 
 
464 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  31.15 
 
 
441 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  33.58 
 
 
443 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  32.43 
 
 
432 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  32.26 
 
 
445 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  30.34 
 
 
443 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  33.87 
 
 
431 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  24.19 
 
 
441 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  34.68 
 
 
431 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  33.87 
 
 
431 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  32.26 
 
 
449 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  22.62 
 
 
450 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  25.22 
 
 
435 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  23.94 
 
 
436 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  22.31 
 
 
440 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>