47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4216 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4216  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2690  hypothetical protein  31.06 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4479  hypothetical protein  31.08 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0874335  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8095  hypothetical protein  28.05 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7036  hypothetical protein  36.46 
 
 
220 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0274  hypothetical protein  30.11 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4206  hypothetical protein  93.33 
 
 
325 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4753  hypothetical protein  31.33 
 
 
296 aa  59.3  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4661  hypothetical protein  34.07 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.782709  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0378  hypothetical protein  29.41 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9167  hypothetical protein  25.71 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4202  hypothetical protein  63.89 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4319  hypothetical protein  36.96 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4449  hypothetical protein  80 
 
 
266 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000448491 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4000  hypothetical protein  73.33 
 
 
273 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.173707 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4197  hypothetical protein  73.33 
 
 
252 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4004  hypothetical protein  75.86 
 
 
273 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0602331 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3965  hypothetical protein  60 
 
 
203 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4198  hypothetical protein  58.97 
 
 
182 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3972  hypothetical protein  70.59 
 
 
183 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.959931 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4194  hypothetical protein  66.67 
 
 
138 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4201  hypothetical protein  66.67 
 
 
214 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4215  hypothetical protein  74.19 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4355  DNA ligase, NAD-dependent  70.37 
 
 
701 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0664546 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3966  hypothetical protein  62.86 
 
 
211 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3948  hypothetical protein  59.52 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4073  hypothetical protein  69.23 
 
 
301 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4213  hypothetical protein  66.67 
 
 
403 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4002  hypothetical protein  80 
 
 
178 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0623784 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3961  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4217  hypothetical protein  41.94 
 
 
203 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4074  hypothetical protein  73.33 
 
 
473 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4003  hypothetical protein  73.08 
 
 
141 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0472244 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4978  hypothetical protein  30.77 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4203  hypothetical protein  63.33 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4007  hypothetical protein  57.14 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0610413 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4200  hypothetical protein  66.67 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4037  hypothetical protein  63.33 
 
 
147 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0430714 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3973  hypothetical protein  55.88 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4419  hypothetical protein  72 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.961916 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.53 
 
 
865 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  23.53 
 
 
861 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  23.53 
 
 
866 aa  43.5  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4005  hypothetical protein  70 
 
 
269 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0442612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  23.53 
 
 
866 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4138  hypothetical protein  75 
 
 
421 aa  43.5  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4193  hypothetical protein  68 
 
 
290 aa  42.7  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>