13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0274 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0274  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  583  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4661  hypothetical protein  77.42 
 
 
289 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.782709  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4978  hypothetical protein  72.89 
 
 
292 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4319  hypothetical protein  70.25 
 
 
294 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4479  hypothetical protein  64.46 
 
 
290 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0874335  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8095  hypothetical protein  63.04 
 
 
295 aa  361  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9167  hypothetical protein  57.19 
 
 
296 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4753  hypothetical protein  58.27 
 
 
296 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0378  hypothetical protein  50.19 
 
 
276 aa  244  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7036  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2690  hypothetical protein  35.29 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4216  hypothetical protein  30.11 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3175  hypothetical protein  28.21 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>