13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9167 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9167  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  611  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4753  hypothetical protein  66.2 
 
 
296 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4978  hypothetical protein  59.25 
 
 
292 aa  345  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8095  hypothetical protein  59.07 
 
 
295 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0274  hypothetical protein  57.19 
 
 
288 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4479  hypothetical protein  56.55 
 
 
290 aa  332  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0874335  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4661  hypothetical protein  59.35 
 
 
289 aa  328  7e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.782709  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4319  hypothetical protein  58.42 
 
 
294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0378  hypothetical protein  48.06 
 
 
276 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7036  hypothetical protein  49.49 
 
 
220 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2690  hypothetical protein  33.6 
 
 
332 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4216  hypothetical protein  25.71 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3175  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  48.9  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>