66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0847 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0847  Protein of unknown function DUF835  100 
 
 		 1007 aa  2019    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0784  isoleucyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 		 1033 aa  95.1  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0185  isoleucyl-tRNA synthetase  22.82 
 
 		 1058 aa  94.7  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.232804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3613  isoleucyl-tRNA synthetase  24.06 
 
 		 1058 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1199  isoleucyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 1034 aa  92  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.847726  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1780  isoleucyl-tRNA synthetase  23.76 
 
 		 1053 aa  89.7  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0700208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0104  isoleucyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 		 1034 aa  89  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0945  isoleucyl-tRNA synthetase  24.57 
 
 		 1040 aa  88.2  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  24.45 
 
 		 1066 aa  87  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00020204  hitchhiker  0.0000151931 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0719  isoleucyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 		 1034 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.280166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  22.99 
 
 		 1068 aa  85.1  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0887  isoleucyl-tRNA synthetase  23.99 
 
 		 1050 aa  83.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0403  isoleucyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 		 1059 aa  82  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.171836  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1055  isoleucyl-tRNA synthetase  23.31 
 
 		 1089 aa  79  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0633304  normal  0.357924 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0130  isoleucyl-tRNA synthetase  21.2 
 
 		 1062 aa  71.2  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.15677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 		 1049 aa  70.5  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  21.62 
 
 		 1037 aa  69.3  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1744  isoleucyl-tRNA synthetase  21.26 
 
 		 1070 aa  69.7  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0606  isoleucyl-tRNA synthetase  20.84 
 
 		 1062 aa  68.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.63379  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1991  isoleucyl-tRNA synthetase  22.48 
 
 		 1086 aa  68.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.670114  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2269  isoleucyl-tRNA synthetase  20.72 
 
 		 1076 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.585384  normal  0.126832 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  21.68 
 
 		 1066 aa  66.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  22.74 
 
 		 1049 aa  64.7  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1825  isoleucyl-tRNA synthetase  21.17 
 
 		 1068 aa  64.3  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1887  isoleucyl-tRNA synthetase  21.53 
 
 		 1080 aa  63.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0011361  decreased coverage  0.00457118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5846  isoleucyl-tRNA synthetase  20.88 
 
 		 1049 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2287  isoleucyl-tRNA synthetase  20.58 
 
 		 1085 aa  58.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00241936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  22.59 
 
 		 883 aa  58.2  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1773  isoleucyl-tRNA synthetase  20.87 
 
 		 1084 aa  56.6  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0211467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0727  isoleucyl-tRNA synthetase  23.6 
 
 		 1069 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.3975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  22.44 
 
 		 865 aa  55.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0152  isoleucyl-tRNA synthetase  18.18 
 
 		 1060 aa  55.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0198182 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  22.16 
 
 		 865 aa  55.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2916  isoleucyl-tRNA synthetase  21.74 
 
 		 1059 aa  54.7  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00208386  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  22.47 
 
 		 991 aa  54.3  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3832  isoleucyl-tRNA synthetase  21.65 
 
 		 1091 aa  54.3  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0322  isoleucyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 		 1079 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204908  normal  0.140126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 879 aa  53.5  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2550  isoleucyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 1039 aa  53.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2865  isoleucyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 1039 aa  53.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1416  isoleucyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 		 1050 aa  53.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.14603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1709  isoleucyl-tRNA synthetase  19.88 
 
 		 1080 aa  53.5  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000389774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  22.36 
 
 		 865 aa  53.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0423  isoleucyl-tRNA synthetase  20.11 
 
 		 1089 aa  52  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.844237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2036  isoleucyl-tRNA synthetase  19.8 
 
 		 1091 aa  52  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00485775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3866  isoleucyl-tRNA synthetase  20.74 
 
 		 1059 aa  51.6  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.265551  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  22.83 
 
 		 869 aa  51.6  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2428  isoleucyl-tRNA synthetase  20.52 
 
 		 1068 aa  51.6  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 		 874 aa  51.2  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  21.28 
 
 		 884 aa  48.5  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3487  isoleucyl-tRNA synthetase  19.35 
 
 		 1059 aa  48.5  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  19.44 
 
 		 891 aa  48.5  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 977 aa  48.1  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0436  isoleucyl-tRNA synthetase  18.63 
 
 		 1108 aa  47.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.31942 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0154  isoleucyl-tRNA synthetase  23.49 
 
 		 1024 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 929 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  21.01 
 
 		 865 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0907  isoleucyl-tRNA synthetase  19.31 
 
 		 1066 aa  47  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 880 aa  46.2  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0068  Protein of unknown function DUF835  25.51 
 
 		 200 aa  46.2  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00278573  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0439  Protein of unknown function DUF835  31.52 
 
 		 213 aa  46.2  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1953  isoleucyl-tRNA synthetase  22.61 
 
 		 1103 aa  45.8  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3676  isoleucyl-tRNA synthetase  19.64 
 
 		 1110 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  20.92 
 
 		 866 aa  44.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0592  isoleucyl-tRNA synthetase  18.39 
 
 		 1135 aa  44.3  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>