16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3893 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3893    100 
 
 		 117 bp  232  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1865  hypothetical protein  100 
 
 		 918 bp  65.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  100 
 
 		 843 bp  65.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  100 
 
 		 843 bp  65.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5454    94.87 
 
 		 285 bp  61.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3624  transposase  96.97 
 
 		 180 bp  58  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102177  normal  0.119692 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1861  hypothetical protein  92.5 
 
 		 336 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  92.11 
 
 		 861 bp  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02990  ISxac3 transposase  92.11 
 
 		 780 bp  52  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5541    94.12 
 
 		 285 bp  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.265794  normal  0.0182876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  91.43 
 
 		 876 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  91.43 
 
 		 876 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  91.43 
 
 		 876 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4612  transposase  91.43 
 
 		 357 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  0.0596523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3685    91.18 
 
 		 228 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  96.15 
 
 		 861 bp  44.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>