40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5454 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5454    100 
 
 		 285 bp  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5541    92.63 
 
 		 285 bp  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.265794  normal  0.0182876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  84.39 
 
 		 861 bp  161  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1861  hypothetical protein  85.81 
 
 		 336 bp  133  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  88.04 
 
 		 861 bp  95.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  85.56 
 
 		 843 bp  75.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  85.56 
 
 		 843 bp  75.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3624  transposase  94 
 
 		 180 bp  75.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102177  normal  0.119692 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1865  hypothetical protein  86.42 
 
 		 918 bp  73.8  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3893    94.87 
 
 		 117 bp  61.9  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2618    83.13 
 
 		 760 bp  54  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.330314  normal  0.98253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3178  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 822 bp  54  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3240  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 822 bp  54  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3190  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 822 bp  54  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2887  Integrase catalytic region  90 
 
 		 816 bp  48.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  96.43 
 
 		 846 bp  48.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1393  Integrase catalytic region  90 
 
 		 816 bp  48.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10270  transposase  96.3 
 
 		 666 bp  46.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  96.3 
 
 		 834 bp  46.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  96.3 
 
 		 834 bp  46.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  96.3 
 
 		 834 bp  46.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 861 bp  46.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4612  transposase  91.43 
 
 		 357 bp  46.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  0.0596523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  91.43 
 
 		 876 bp  46.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  91.43 
 
 		 876 bp  46.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  91.43 
 
 		 876 bp  46.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  86.27 
 
 		 867 bp  46.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5990  integrase catalytic subunit  96.3 
 
 		 828 bp  46.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684507 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5589  integrase catalytic subunit  96.3 
 
 		 828 bp  46.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>