36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04560 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04560  60S ribosomal protein L24b (AFU_orthologue; AFUA_2G02710)  100 
 
 
190 aa  383  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59191  predicted protein  58.28 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.32572  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03010  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  61.16 
 
 
200 aa  160  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119514  ribosome biogenesis protein RLP24, probable  48.25 
 
 
174 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.42721  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_7346  predicted protein  56.07 
 
 
134 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0525  Ribosomal protein L24E  51.67 
 
 
63 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1499  50S ribosomal protein L24E  50 
 
 
63 aa  65.9  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.172972 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0453  Ribosomal protein L24E  44.64 
 
 
131 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.541731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0688  ribosomal protein L24E  45.61 
 
 
63 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0719  ribosomal protein L24E  44.83 
 
 
63 aa  62  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0204081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0752  Ribosomal protein L24E  41.82 
 
 
139 aa  59.7  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.643216  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1603  ribosomal protein L24E  46.43 
 
 
63 aa  59.3  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2623  Ribosomal protein L24E  41.82 
 
 
143 aa  58.9  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.236827  normal  0.837935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2525  Ribosomal protein L24E  41.07 
 
 
121 aa  58.2  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0079  ribosomal protein L24E  46.15 
 
 
64 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0227  50S ribosomal protein L24E  44.44 
 
 
66 aa  55.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02920  60S ribosomal protein L24 (L30), putative  35.05 
 
 
150 aa  55.5  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0311  ribosomal protein L24E  40.74 
 
 
70 aa  53.9  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0965  50S ribosomal protein L24e  50 
 
 
62 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0250  50S ribosomal protein L24e  50 
 
 
62 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.169241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0221  50S ribosomal protein L24e  41.07 
 
 
62 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000165894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1555  50S ribosomal protein L24e  50 
 
 
62 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.953863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1663  50S ribosomal protein L24e  48.08 
 
 
62 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076779  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0500  ribosomal protein L24E  43.4 
 
 
63 aa  51.6  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.909951  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88185  predicted protein  38.46 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0390204  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0442  50S ribosomal protein L24e  41.94 
 
 
62 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0588  50S ribosomal protein L24e  42.59 
 
 
58 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.963805  hitchhiker  0.000164572 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1238  Ribosomal protein L24E  42.31 
 
 
81 aa  48.5  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1758  50S ribosomal protein L24e  40.74 
 
 
65 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0237354  hitchhiker  0.00246446 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0333  ribosomal protein L24E  40 
 
 
56 aa  48.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43138  Ribosomal protein L24, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  27.55 
 
 
127 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3386  50S ribosomal protein L24e  37.5 
 
 
62 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000000670233  normal  0.0607523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1208  Ribosomal protein L24E  43.75 
 
 
61 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.568383  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08704  60S ribosomal protein L24a (AFU_orthologue; AFUA_6G02440)  38.46 
 
 
160 aa  45.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1579  50S ribosomal protein L24e  42.59 
 
 
58 aa  45.1  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0028  50S ribosomal protein L24E  38 
 
 
61 aa  41.6  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00870941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>