32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0028 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0028  50S ribosomal protein L24E  100 
 
 		 61 aa  130  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00870941 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1208  Ribosomal protein L24E  70.49 
 
 		 61 aa  97.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.568383  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0442  50S ribosomal protein L24e  56 
 
 		 62 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1238  Ribosomal protein L24E  44.07 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1579  50S ribosomal protein L24e  56 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1758  50S ribosomal protein L24e  45.45 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0237354  hitchhiker  0.00246446 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0500  ribosomal protein L24E  50 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.909951  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0227  50S ribosomal protein L24E  45.28 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0588  50S ribosomal protein L24e  48 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.963805  hitchhiker  0.000164572 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0311  ribosomal protein L24E  43.64 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0688  ribosomal protein L24E  46.43 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0752  Ribosomal protein L24E  42.86 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.643216  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1603  ribosomal protein L24E  42.86 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0525  Ribosomal protein L24E  42.86 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0965  50S ribosomal protein L24e  44.44 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0250  50S ribosomal protein L24e  44.44 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.169241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0453  Ribosomal protein L24E  42.59 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.541731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0719  ribosomal protein L24E  39.34 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0204081  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1555  50S ribosomal protein L24e  44.44 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.953863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1663  50S ribosomal protein L24e  42.59 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03010  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  40.74 
 
 		 200 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2623  Ribosomal protein L24E  41.18 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.236827  normal  0.837935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1499  50S ribosomal protein L24E  37.1 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.172972 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0333  ribosomal protein L24E  41.18 
 
 		 56 aa  50.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0079  ribosomal protein L24E  48.08 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2525  Ribosomal protein L24E  37.29 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59191  predicted protein  38.18 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.32572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1844  Ribosomal protein L24E  38.6 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00160492  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119514  ribosome biogenesis protein RLP24, probable  41.51 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.42721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0221  50S ribosomal protein L24e  45.71 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000165894  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_7346  predicted protein  36.21 
 
 		 134 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04560  60S ribosomal protein L24b (AFU_orthologue; AFUA_2G02710)  38 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>