32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3386 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3386  50S ribosomal protein L24e  100 
 
 		 62 aa  130  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000000670233  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0221  50S ribosomal protein L24e  74.19 
 
 		 62 aa  100  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000165894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1499  50S ribosomal protein L24E  58.93 
 
 		 63 aa  80.9  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.172972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0525  Ribosomal protein L24E  55.74 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0688  ribosomal protein L24E  57.14 
 
 		 63 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0719  ribosomal protein L24E  55.36 
 
 		 63 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0204081  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1603  ribosomal protein L24E  51.61 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0333  ribosomal protein L24E  56.36 
 
 		 56 aa  71.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2525  Ribosomal protein L24E  50 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2623  Ribosomal protein L24E  50.94 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.236827  normal  0.837935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0079  ribosomal protein L24E  57.69 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0453  Ribosomal protein L24E  46.43 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.541731  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0752  Ribosomal protein L24E  49.06 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.643216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1663  50S ribosomal protein L24e  55.77 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0250  50S ribosomal protein L24e  55.77 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.169241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0965  50S ribosomal protein L24e  55.77 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1238  Ribosomal protein L24E  56.25 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1555  50S ribosomal protein L24e  55.77 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.953863  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1844  Ribosomal protein L24E  44.83 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00160492  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03010  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  42.31 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0442  50S ribosomal protein L24e  40.32 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119514  ribosome biogenesis protein RLP24, probable  37.74 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.42721  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0588  50S ribosomal protein L24e  45.45 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.963805  hitchhiker  0.000164572 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_7346  predicted protein  38.78 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1208  Ribosomal protein L24E  42.31 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.568383  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04560  60S ribosomal protein L24b (AFU_orthologue; AFUA_2G02710)  37.5 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1579  50S ribosomal protein L24e  41.82 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1758  50S ribosomal protein L24e  41.82 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0237354  hitchhiker  0.00246446 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0500  ribosomal protein L24E  46 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.909951  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0227  50S ribosomal protein L24E  38 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88185  predicted protein  40 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0390204  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59191  predicted protein  33.33 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.32572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>