27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88185 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_88185  predicted protein  100 
 
 		 155 aa  307  2.9999999999999997e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0390204  normal  0.523172 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08704  60S ribosomal protein L24a (AFU_orthologue; AFUA_6G02440)  73.68 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02920  60S ribosomal protein L24 (L30), putative  54.48 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19152  predicted protein  42 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43138  Ribosomal protein L24, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.3 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03010  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  31.86 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_7346  predicted protein  36.84 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119514  ribosome biogenesis protein RLP24, probable  37.23 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.42721  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59191  predicted protein  35.56 
 
 		 198 aa  62  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.32572  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04560  60S ribosomal protein L24b (AFU_orthologue; AFUA_2G02710)  27.03 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1499  50S ribosomal protein L24E  47.83 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.172972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0525  Ribosomal protein L24E  34.62 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0442  50S ribosomal protein L24e  41.51 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0453  Ribosomal protein L24E  34.78 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.541731  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1579  50S ribosomal protein L24e  37.74 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0688  ribosomal protein L24E  37.5 
 
 		 63 aa  43.9  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0719  ribosomal protein L24E  35.42 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0204081  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0588  50S ribosomal protein L24e  35.85 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.963805  hitchhiker  0.000164572 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1758  50S ribosomal protein L24e  33.85 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0237354  hitchhiker  0.00246446 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1238  Ribosomal protein L24E  34.55 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1208  Ribosomal protein L24E  38 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.568383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2525  Ribosomal protein L24E  33.33 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3386  50S ribosomal protein L24e  40 
 
 		 62 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000000670233  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1555  50S ribosomal protein L24e  35 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.953863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0221  50S ribosomal protein L24e  41.3 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000165894  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1603  ribosomal protein L24E  30.77 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0311  ribosomal protein L24E  35.85 
 
 		 70 aa  40.8  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>