35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1238 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1238  Ribosomal protein L24E  100 
 
 		 81 aa  171  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1603  ribosomal protein L24E  59.32 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0688  ribosomal protein L24E  55.93 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0719  ribosomal protein L24E  57.38 
 
 		 63 aa  77.4  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0204081  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1208  Ribosomal protein L24E  57.63 
 
 		 61 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.568383  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1499  50S ribosomal protein L24E  55.74 
 
 		 63 aa  77  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.172972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0525  Ribosomal protein L24E  57.63 
 
 		 63 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0752  Ribosomal protein L24E  51.72 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.643216  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0333  ribosomal protein L24E  60.42 
 
 		 56 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0079  ribosomal protein L24E  55.36 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0028  50S ribosomal protein L24E  44.07 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00870941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2623  Ribosomal protein L24E  47.46 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.236827  normal  0.837935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0221  50S ribosomal protein L24e  51.92 
 
 		 62 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000165894  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0500  ribosomal protein L24E  51.85 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.909951  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0227  50S ribosomal protein L24E  49.06 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1663  50S ribosomal protein L24e  51.85 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3386  50S ribosomal protein L24e  56.25 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000000670233  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0965  50S ribosomal protein L24e  50 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0250  50S ribosomal protein L24e  50 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.169241  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1555  50S ribosomal protein L24e  50 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.953863  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03010  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  49.06 
 
 		 200 aa  60.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0453  Ribosomal protein L24E  49.18 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.541731  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0442  50S ribosomal protein L24e  50 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2525  Ribosomal protein L24E  47.54 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1758  50S ribosomal protein L24e  45.76 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0237354  hitchhiker  0.00246446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1579  50S ribosomal protein L24e  48 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0588  50S ribosomal protein L24e  47.92 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.963805  hitchhiker  0.000164572 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119514  ribosome biogenesis protein RLP24, probable  48.08 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.42721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0311  ribosomal protein L24E  39.62 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1844  Ribosomal protein L24E  41.67 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00160492  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59191  predicted protein  41.51 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.32572  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04560  60S ribosomal protein L24b (AFU_orthologue; AFUA_2G02710)  42.31 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_7346  predicted protein  41.51 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88185  predicted protein  34.55 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0390204  normal  0.523172 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08704  60S ribosomal protein L24a (AFU_orthologue; AFUA_6G02440)  32.08 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>