36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0442 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0442  50S ribosomal protein L24e  100 
 
 		 62 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1579  50S ribosomal protein L24e  87.72 
 
 		 58 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1758  50S ribosomal protein L24e  83.05 
 
 		 65 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0237354  hitchhiker  0.00246446 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0588  50S ribosomal protein L24e  77.19 
 
 		 58 aa  99.4  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.963805  hitchhiker  0.000164572 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0311  ribosomal protein L24E  72.73 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0500  ribosomal protein L24E  58.33 
 
 		 63 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.909951  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1208  Ribosomal protein L24E  56.86 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.568383  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0028  50S ribosomal protein L24E  56 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00870941 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03010  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  50 
 
 		 200 aa  60.5  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0525  Ribosomal protein L24E  46.3 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0752  Ribosomal protein L24E  47.17 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.643216  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1238  Ribosomal protein L24E  50 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2623  Ribosomal protein L24E  47.17 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.236827  normal  0.837935 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59191  predicted protein  46.3 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.32572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0453  Ribosomal protein L24E  47.17 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.541731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0688  ribosomal protein L24E  45.76 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119514  ribosome biogenesis protein RLP24, probable  44.83 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.42721  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_7346  predicted protein  48.15 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0333  ribosomal protein L24E  47.27 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1499  50S ribosomal protein L24E  45.28 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.172972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0227  50S ribosomal protein L24E  41.51 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2525  Ribosomal protein L24E  44 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1603  ribosomal protein L24E  45.28 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0221  50S ribosomal protein L24e  40 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000165894  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04560  60S ribosomal protein L24b (AFU_orthologue; AFUA_2G02710)  41.94 
 
 		 190 aa  50.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1555  50S ribosomal protein L24e  49.06 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.953863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0719  ribosomal protein L24E  45.83 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0204081  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0250  50S ribosomal protein L24e  49.06 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.169241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0965  50S ribosomal protein L24e  49.06 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3386  50S ribosomal protein L24e  40.32 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000000670233  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1663  50S ribosomal protein L24e  47.17 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88185  predicted protein  41.51 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0390204  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0079  ribosomal protein L24E  43.4 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02920  60S ribosomal protein L24 (L30), putative  38.89 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1844  Ribosomal protein L24E  28.81 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00160492  normal  0.191056 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08704  60S ribosomal protein L24a (AFU_orthologue; AFUA_6G02440)  39.62 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>