47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1119 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1119  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
430 aa  837    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3265  VWA containing CoxE-like  58.99 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0231  von Willebrand factor type A  31.96 
 
 
509 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1379  hypothetical protein  31.72 
 
 
536 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1236  hypothetical protein  29.07 
 
 
612 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607266  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0174  von Willebrand factor type A  31.73 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0667  von Willebrand factor, type A  30.24 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.949287  normal  0.0104959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3328  hypothetical protein  27.24 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0584  hypothetical protein  29.05 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.533513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0963  hypothetical protein  23.83 
 
 
492 aa  71.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4270  hypothetical protein  32.63 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.493639  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4161  hypothetical protein  32.63 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4534  hypothetical protein  29.86 
 
 
492 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4105  hypothetical protein  32.63 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338491  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4211  hypothetical protein  32.63 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4119  hypothetical protein  32.63 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  0.0172614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1703  von Willebrand factor, type A  22.71 
 
 
527 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1813  von Willebrand factor, type A  22.98 
 
 
527 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0321559 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4181  hypothetical protein  28.71 
 
 
491 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.981735  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4090  hypothetical protein  32.11 
 
 
483 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4244  hypothetical protein  28.57 
 
 
492 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4113  hypothetical protein  29.36 
 
 
483 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218844  normal  0.154025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3981  hypothetical protein  28.32 
 
 
493 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4261  hypothetical protein  28.94 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03629  predicted von Willibrand factor containing protein  28.94 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4249  hypothetical protein  28.94 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4222  von Willebrand factor type A  28.94 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3961  hypothetical protein  28.94 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03573  hypothetical protein  28.94 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.585554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5181  hypothetical protein  28.94 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108838  normal  0.131102 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4176  hypothetical protein  28.94 
 
 
483 aa  61.6  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000049  hypothetical protein  25.22 
 
 
484 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.368804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2920  von Willebrand factor, type A  26.03 
 
 
528 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2514  von Willebrand factor, type A  20.9 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.513859  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0703  hypothetical protein  24.42 
 
 
481 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4904  hypothetical protein  29.36 
 
 
487 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00108067  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1892  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  32.34 
 
 
488 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2705  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  30.23 
 
 
581 aa  56.6  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05671  hypothetical protein  24.58 
 
 
485 aa  56.6  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26466  predicted protein  25.47 
 
 
535 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.377719  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  33.82 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4213  hypothetical protein  29.61 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0004  hypothetical protein  29.61 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.729255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0004  hypothetical protein  29.61 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000586719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.89 
 
 
460 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 
472 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.85 
 
 
338 aa  43.5  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>