47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3981 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4534  hypothetical protein  70.39 
 
 
492 aa  722    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4244  hypothetical protein  70.39 
 
 
492 aa  719    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4181  hypothetical protein  76.47 
 
 
491 aa  773    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.981735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3981  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1017    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4222  von Willebrand factor type A  59.38 
 
 
483 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03573  hypothetical protein  59.38 
 
 
483 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.585554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5181  hypothetical protein  59.38 
 
 
483 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108838  normal  0.131102 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4176  hypothetical protein  59.17 
 
 
483 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4249  hypothetical protein  59.38 
 
 
483 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4261  hypothetical protein  59.38 
 
 
483 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3961  hypothetical protein  59.38 
 
 
483 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03629  predicted von Willibrand factor containing protein  59.38 
 
 
483 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4113  hypothetical protein  59.17 
 
 
483 aa  598  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218844  normal  0.154025 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4119  hypothetical protein  57.26 
 
 
483 aa  592  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  0.0172614 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4213  hypothetical protein  58.04 
 
 
488 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0004  hypothetical protein  58.04 
 
 
488 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000586719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0004  hypothetical protein  58.04 
 
 
488 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.729255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4090  hypothetical protein  58.54 
 
 
483 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4270  hypothetical protein  58.33 
 
 
483 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.493639  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4105  hypothetical protein  58.33 
 
 
483 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338491  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4161  hypothetical protein  58.33 
 
 
483 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4211  hypothetical protein  58.33 
 
 
483 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4904  hypothetical protein  56.69 
 
 
487 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00108067  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05671  hypothetical protein  33.33 
 
 
485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000049  hypothetical protein  33.54 
 
 
484 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.368804  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0703  hypothetical protein  32.26 
 
 
481 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0584  hypothetical protein  30.88 
 
 
482 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.533513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0963  hypothetical protein  28.99 
 
 
492 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95976 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2808  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 
529 aa  153  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000261392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0060  von Willebrand factor type A  25.14 
 
 
478 aa  143  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104862  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1813  von Willebrand factor, type A  29.75 
 
 
527 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0321559 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1703  von Willebrand factor, type A  29.14 
 
 
527 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2920  von Willebrand factor, type A  30.65 
 
 
528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2514  von Willebrand factor, type A  24.86 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.513859  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1236  hypothetical protein  29.25 
 
 
612 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607266  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0032  conserved hypothetical protein, putative VWA domain protein  26.62 
 
 
474 aa  113  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.822803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3328  hypothetical protein  27.3 
 
 
562 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2705  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  31.19 
 
 
581 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26466  predicted protein  31.25 
 
 
535 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.377719  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0231  von Willebrand factor type A  33.21 
 
 
509 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1892  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  29.56 
 
 
488 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3512  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  32.48 
 
 
493 aa  88.6  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0398752  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3265  VWA containing CoxE-like  28.25 
 
 
430 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1379  hypothetical protein  27.16 
 
 
536 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1119  VWA containing CoxE family protein  29.78 
 
 
430 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0667  von Willebrand factor, type A  24.36 
 
 
451 aa  44.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.949287  normal  0.0104959 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0174  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 
452 aa  43.1  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>