47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3961 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4211  hypothetical protein  87.95 
 
 		 483 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4261  hypothetical protein  99.59 
 
 		 483 aa  984    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4904  hypothetical protein  64.5 
 
 		 487 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00108067  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0004  hypothetical protein  64.34 
 
 		 488 aa  644    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.729255 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4213  hypothetical protein  64.34 
 
 		 488 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4249  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  988    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4113  hypothetical protein  99.17 
 
 		 483 aa  980    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218844  normal  0.154025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4176  hypothetical protein  99.59 
 
 		 483 aa  984    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4161  hypothetical protein  88.16 
 
 		 483 aa  853    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4222  von Willebrand factor type A  99.79 
 
 		 483 aa  986    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4090  hypothetical protein  87.95 
 
 		 483 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4105  hypothetical protein  87.95 
 
 		 483 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338491  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4270  hypothetical protein  88.16 
 
 		 483 aa  853    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.493639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5181  hypothetical protein  99.79 
 
 		 483 aa  986    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108838  normal  0.131102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03573  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  988    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.585554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4181  hypothetical protein  62.63 
 
 		 491 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.981735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4244  hypothetical protein  63.04 
 
 		 492 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4534  hypothetical protein  63.04 
 
 		 492 aa  644    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3961  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  988    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0004  hypothetical protein  64.34 
 
 		 488 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000586719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03629  predicted von Willibrand factor containing protein  100 
 
 		 483 aa  988    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4119  hypothetical protein  81.16 
 
 		 483 aa  806    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  0.0172614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3981  hypothetical protein  59.51 
 
 		 493 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0703  hypothetical protein  33.67 
 
 		 481 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0584  hypothetical protein  32.71 
 
 		 482 aa  289  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.533513  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05671  hypothetical protein  33.88 
 
 		 485 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000049  hypothetical protein  33.81 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.368804  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0963  hypothetical protein  30.18 
 
 		 492 aa  163  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95976 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2808  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 		 529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000261392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0060  von Willebrand factor type A  27.74 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104862  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2514  von Willebrand factor, type A  27.49 
 
 		 529 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.513859  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2920  von Willebrand factor, type A  30.52 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1813  von Willebrand factor, type A  28.75 
 
 		 527 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0321559 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1703  von Willebrand factor, type A  28.44 
 
 		 527 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3328  hypothetical protein  25.84 
 
 		 562 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1236  hypothetical protein  27.84 
 
 		 612 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0032  conserved hypothetical protein, putative VWA domain protein  25.34 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.822803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2705  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  28.9 
 
 		 581 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26466  predicted protein  27.43 
 
 		 535 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.377719  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1892  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  31.5 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0231  von Willebrand factor type A  30.28 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3512  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  29.6 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0398752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3265  VWA containing CoxE-like  31.25 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1379  hypothetical protein  24.9 
 
 		 536 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1119  VWA containing CoxE family protein  27.98 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0667  von Willebrand factor, type A  25.45 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.949287  normal  0.0104959 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0174  von Willebrand factor type A  33.64 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>