47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1892 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1892  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  100 
 
 		 488 aa  961    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3512  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  55.67 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0398752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2705  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  43.61 
 
 		 581 aa  336  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1813  von Willebrand factor, type A  36.62 
 
 		 527 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0321559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2920  von Willebrand factor, type A  35.8 
 
 		 528 aa  207  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1703  von Willebrand factor, type A  35.69 
 
 		 527 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26466  predicted protein  34.47 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.377719  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2808  von Willebrand factor type A  25.08 
 
 		 529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000261392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2514  von Willebrand factor, type A  29.77 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.513859  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4119  hypothetical protein  31.89 
 
 		 483 aa  109  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  0.0172614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3328  hypothetical protein  28.14 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000049  hypothetical protein  26.36 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.368804  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4090  hypothetical protein  32.28 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4270  hypothetical protein  31.89 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.493639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0703  hypothetical protein  27.13 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4105  hypothetical protein  31.89 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05671  hypothetical protein  26.25 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4211  hypothetical protein  31.89 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4161  hypothetical protein  31.89 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1379  hypothetical protein  30.71 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4904  hypothetical protein  28.57 
 
 		 487 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00108067  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5181  hypothetical protein  31.5 
 
 		 483 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108838  normal  0.131102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4222  von Willebrand factor type A  31.5 
 
 		 483 aa  103  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4249  hypothetical protein  31.5 
 
 		 483 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03629  predicted von Willibrand factor containing protein  31.5 
 
 		 483 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03573  hypothetical protein  31.5 
 
 		 483 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.585554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3961  hypothetical protein  31.5 
 
 		 483 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4261  hypothetical protein  31.5 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4113  hypothetical protein  31.5 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218844  normal  0.154025 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0032  conserved hypothetical protein, putative VWA domain protein  21.76 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.822803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4176  hypothetical protein  31.1 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1236  hypothetical protein  24.53 
 
 		 612 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0584  hypothetical protein  26.14 
 
 		 482 aa  101  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.533513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4244  hypothetical protein  29.18 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3981  hypothetical protein  29.56 
 
 		 493 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0963  hypothetical protein  23.73 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4534  hypothetical protein  28.52 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4181  hypothetical protein  30.65 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.981735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0004  hypothetical protein  27.68 
 
 		 488 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000586719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0004  hypothetical protein  27.68 
 
 		 488 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.729255 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4213  hypothetical protein  27.68 
 
 		 488 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0231  von Willebrand factor type A  29.13 
 
 		 509 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0060  von Willebrand factor type A  23.26 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3265  VWA containing CoxE-like  29.87 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57113  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0174  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0667  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.949287  normal  0.0104959 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  21.45 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>