47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4244 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4534  hypothetical protein  97.56 
 
 		 492 aa  968    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4244  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  1010    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4181  hypothetical protein  72.51 
 
 		 491 aa  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.981735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3981  hypothetical protein  70.39 
 
 		 493 aa  739    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4119  hypothetical protein  63.66 
 
 		 483 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  0.0172614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4261  hypothetical protein  63.18 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4222  von Willebrand factor type A  62.97 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03573  hypothetical protein  62.97 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.585554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5181  hypothetical protein  62.97 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108838  normal  0.131102 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4176  hypothetical protein  62.76 
 
 		 483 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4249  hypothetical protein  62.97 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3961  hypothetical protein  62.97 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03629  predicted von Willibrand factor containing protein  62.97 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4090  hypothetical protein  62.55 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4113  hypothetical protein  62.76 
 
 		 483 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218844  normal  0.154025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4211  hypothetical protein  62.34 
 
 		 483 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4161  hypothetical protein  62.34 
 
 		 483 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0004  hypothetical protein  62.83 
 
 		 488 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000586719  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4105  hypothetical protein  62.34 
 
 		 483 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338491  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4270  hypothetical protein  62.34 
 
 		 483 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.493639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0004  hypothetical protein  62.83 
 
 		 488 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.729255 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4213  hypothetical protein  62.83 
 
 		 488 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4904  hypothetical protein  61.34 
 
 		 487 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00108067  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05671  hypothetical protein  33.74 
 
 		 485 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000049  hypothetical protein  34.01 
 
 		 484 aa  281  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.368804  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0703  hypothetical protein  32.19 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0584  hypothetical protein  30.27 
 
 		 482 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.533513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0963  hypothetical protein  28.12 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95976 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2808  von Willebrand factor type A  30.14 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000261392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2920  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 		 528 aa  134  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0060  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104862  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1703  von Willebrand factor, type A  32.19 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2514  von Willebrand factor, type A  25.95 
 
 		 529 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.513859  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1813  von Willebrand factor, type A  31.93 
 
 		 527 aa  128  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0321559 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0032  conserved hypothetical protein, putative VWA domain protein  26.67 
 
 		 474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.822803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2705  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  31.19 
 
 		 581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26466  predicted protein  31.58 
 
 		 535 aa  113  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.377719  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1236  hypothetical protein  28.87 
 
 		 612 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3328  hypothetical protein  27.21 
 
 		 562 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1892  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  29.18 
 
 		 488 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0231  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 		 509 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3512  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  29.75 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0398752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3265  VWA containing CoxE-like  31.25 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1379  hypothetical protein  31.07 
 
 		 536 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1119  VWA containing CoxE family protein  34.44 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0667  von Willebrand factor, type A  27.14 
 
 		 451 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.949287  normal  0.0104959 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0174  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>