37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2378 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2378  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0168  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1036  hypothetical protein  51.92 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1074  hypothetical protein  53.85 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0150  hypothetical protein  55.77 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3943  carbon storage regulator, putative  49.18 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0829  carbon storage regulator, CsrA  47.17 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267846  normal  0.671396 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1511  carbon storage regulator, CsrA  43.08 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0845  carbon storage regulator  40.32 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0820  carbon storage regulator  40.32 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0440  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  47.37 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0992  carbon storage regulator, CsrA  46.94 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2239  carbon storage regulator, CsrA  50 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2180  carbon storage regulator  48.15 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000766947  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0146  carbon storage regulator  48.15 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000207191  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0668  carbon storage regulator, CsrA  53.06 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0341  carbon storage regulator  51.79 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3761  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0455411  normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3977  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4472  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.197057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1443  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139984  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4273  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000441223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3554  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00116705  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1844  carbon storage regulator  39.22 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0833226  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0714  carbon storage regulator  46.94 
 
 		 75 aa  42  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3026  carbon storage regulator  45.31 
 
 		 82 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1338  carbon storage regulator, CsrA  41.67 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0439  carbon storage regulator, CsrA  48.98 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0102  carbon storage regulator  41.51 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0088  carbon storage regulator  41.51 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3427  carbon storage regulator  42.59 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.067647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1043  carbon storage regulator  33.85 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3224  carbon storage regulator  49.15 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1973  carbon storage regulator  46.81 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3338  carbon storage regulator  33.87 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0466737  hitchhiker  0.0000666131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2232  carbon storage regulator  45.28 
 
 		 78 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000917827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4097  carbon storage regulator, CsrA  47.17 
 
 		 79 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>