28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0649 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  277  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  99.25 
 
 
134 aa  275  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  44.03 
 
 
134 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  41.79 
 
 
134 aa  121  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.85 
 
 
135 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  38.28 
 
 
349 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  40.77 
 
 
360 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  39.69 
 
 
355 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  36.43 
 
 
356 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  37.8 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  36.57 
 
 
355 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  34.59 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  33.83 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  33.08 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  35.43 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  33.07 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.59 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  30.83 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  32.79 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.61 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  29.84 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  24.79 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  25.81 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0458  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.78691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0081  hypothetical protein  26.15 
 
 
320 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>