16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3025 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3025  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  261  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3412  hypothetical protein  46.48 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  46.81 
 
 
144 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  44.68 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  41.55 
 
 
151 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  36.23 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  36.62 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  38.03 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  36.03 
 
 
235 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  36.67 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  37.14 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  29.29 
 
 
137 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  34.31 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  30.66 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13418  hypothetical protein  29.79 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000730946  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1717  PilT domain-containing protein  36.62 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>