18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2050 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2050  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 112 aa  219  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  53.64 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  45.45 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  47.83 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  38.3 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2967  anti-sigma-factor antagonist  43.9 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  40.82 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35230  STAS domain-containing protein  39.36 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3141  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.129085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2078  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  31.75 
 
 		 332 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000182563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3637  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>