18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5090 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_5090  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  353  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4350  hypothetical protein  54.34 
 
 
172 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4927  hypothetical protein  51.12 
 
 
177 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0673  hypothetical protein  48.77 
 
 
178 aa  171  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6493  hypothetical protein  49.72 
 
 
171 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1752  hypothetical protein  60.29 
 
 
191 aa  87.8  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.707252  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0446  hypothetical protein  62.3 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647617  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0159  hypothetical protein  51.81 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6508  hypothetical protein  53.62 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2659  hypothetical protein  52.17 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5040  putative secreted protein  46.25 
 
 
212 aa  74.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4184  hypothetical protein  29.94 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166857  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6220  hypothetical protein  28.41 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9830  hypothetical protein  26.74 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0874  hypothetical protein  50 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4570  hypothetical protein  24.86 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4449  hypothetical protein  32 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581783  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6413  hypothetical protein  26.55 
 
 
198 aa  41.2  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>