23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4610 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4610  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695949  normal  0.162062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  36.27 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  35.45 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  30.51 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  30.51 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  35.94 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  36.59 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  43.48 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  36.54 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  44.23 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 139 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  38.3 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  38.3 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  38.3 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  38.3 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4110  hypothetical protein  33.02 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  29.52 
 
 		 145 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>