20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3716 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  330  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  52.17 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  46.3 
 
 
159 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0865  hypothetical protein  41.46 
 
 
162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1364  hypothetical protein  37.42 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2417  hypothetical protein  46.85 
 
 
246 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  37.8 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  38.93 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3540  hypothetical protein  36.71 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  30.57 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6233  hypothetical protein  32.08 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7012  hypothetical protein  32.08 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  34.42 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  28.57 
 
 
222 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0281  hypothetical protein  28.06 
 
 
142 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  32.68 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  34.88 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  33.07 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  33.59 
 
 
153 aa  53.9  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0866  hypothetical protein  26.38 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>