28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3396 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3396  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4964  hypothetical protein  86.54 
 
 
156 aa  280  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.698378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3097  hypothetical protein  73.72 
 
 
153 aa  227  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  60.65 
 
 
156 aa  193  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1599  hypothetical protein  70.15 
 
 
153 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688282  normal  0.585844 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  60 
 
 
156 aa  190  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0901  hypothetical protein  65.67 
 
 
239 aa  190  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0678724  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0782  hypothetical protein  66.18 
 
 
155 aa  190  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.571559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1980  hypothetical protein  66.18 
 
 
155 aa  190  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.232355  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0674  hypothetical protein  66.18 
 
 
155 aa  190  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.015637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0562  hypothetical protein  66.18 
 
 
155 aa  190  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  61.84 
 
 
155 aa  189  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2077  hypothetical protein  66.18 
 
 
155 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531924  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0492  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  66.18 
 
 
277 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3289  hypothetical protein  64.71 
 
 
156 aa  186  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0867592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5166  hypothetical protein  62.18 
 
 
155 aa  183  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3214  hypothetical protein  55.56 
 
 
157 aa  177  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1290  hypothetical protein  55.56 
 
 
157 aa  177  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  53.59 
 
 
156 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4087  hypothetical protein  57.24 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.399189  normal  0.196197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3435  hypothetical protein  56.58 
 
 
160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0225  hypothetical protein  50.64 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00533526  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  46.79 
 
 
157 aa  158  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0659  hypothetical protein  43.45 
 
 
169 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.217066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4068  hypothetical protein  30.92 
 
 
156 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1666  hypothetical protein  31.13 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1987  hypothetical protein  32.88 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  27.82 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>