28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3311 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3311  molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
135 aa  269  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1691  hypothetical protein  58.02 
 
 
134 aa  148  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2232  hypothetical protein  53.33 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843769  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2632  hypothetical protein  51.85 
 
 
152 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0772  ferredoxin  53.91 
 
 
134 aa  140  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2045  hypothetical protein  49.63 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3531  hypothetical protein  49.63 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1934  hypothetical protein  48.89 
 
 
135 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.896486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1766  hypothetical protein  47.41 
 
 
135 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3027  hypothetical protein  46.67 
 
 
135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  49.23 
 
 
360 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2674  putative cytoplasmic protein  45.19 
 
 
135 aa  120  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  47.33 
 
 
349 aa  120  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  53.12 
 
 
355 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0649  hypothetical protein  39.85 
 
 
134 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0665  hypothetical protein  39.1 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.86 
 
 
145 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  42.22 
 
 
356 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4395  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.6 
 
 
134 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.779204  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0279  conserved hypothetical cytosolic protein  45.19 
 
 
135 aa  104  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  44.19 
 
 
355 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2617  hypothetical protein  38.17 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2883  hypothetical protein  38.93 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0368  hypothetical protein  27.01 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4368  hypothetical protein  29.63 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0509  hypothetical protein  37.21 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2758  hypothetical protein  34.26 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000647849  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0536  hypothetical protein  25 
 
 
224 aa  40  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.368426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>