18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3159 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  100 
 
 
106 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  40.2 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  36.63 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  36.63 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  34.65 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4970  phage head-tail adaptor  35.78 
 
 
117 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1427  phage head-tail adaptor  35.16 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  0.2809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1701  phage head-tail adaptor  34.41 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.228407  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1652  phage head-tail adaptor  31.73 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1814  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00514089  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2107  phage head-tail adaptor  31.07 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913965  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1135  phage head-tail adaptor, putative  32.69 
 
 
111 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1423  phage head-tail adaptor  37.5 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6053  putative phage tail-head adaptor  32.41 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  28.16 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1637  hypothetical protein  27.52 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1080  phage head-tail adaptor, putative  31.73 
 
 
111 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.130936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1981  hypothetical protein  28.92 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.50206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>