15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1960 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1960  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 704 aa  1389    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38724  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3715  lipopolysaccharide biosynthesis  32.41 
 
 		 712 aa  317  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  24.4 
 
 		 487 aa  94.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1529  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 499 aa  94  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417351  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  21.77 
 
 		 509 aa  90.5  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2878  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  23.9 
 
 		 257 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0976  chromosome partitioning ATPase protein-like  36.36 
 
 		 242 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  28.24 
 
 		 784 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1072  chromosome partitioning ATPase  32.53 
 
 		 240 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2020  lipopolysaccharide biosynthesis  22.76 
 
 		 530 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  26.67 
 
 		 784 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3189  chromosome partitioning ATPase  31.33 
 
 		 240 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  28.3 
 
 		 1108 aa  43.9  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>