64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0391 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0391  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 342 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0860  high-affinity nickel-transporter  42.23 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  43.66 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  42.66 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1782  high-affinity nickel-transporter  43.95 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2905  high-affinity nickel-transporter  42.15 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
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NC_010581  Bind_0081  high-affinity nickel-transporter  39.37 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.940198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  38.95 
 
 		 358 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  39.08 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2245  high-affinity nickel-transporter  43.84 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  39.7 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  39.52 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0277  high-affinity nickel-transporter  44.9 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66329  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1678  high-affinity nickel-transporter  42.51 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0510109  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  33.89 
 
 		 389 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1398  high-affinity nickel-transporter  41.9 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0677472  normal  0.0633291 
 
 
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NC_009504  BOV_A0088  hypothetical protein  35.35 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA0096  hypothetical protein  35.35 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_1403  high-affinity nickel-transporter  42.91 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198577  normal  0.0338124 
 
 
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NC_009485  BBta_1353  putative high affinity nickel transporter  56.46 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.85251  normal  0.315811 
 
 
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NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  38.35 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0942  high-affinity nickel-transporter  52.23 
 
 		 384 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0338054  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  36.32 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  37.65 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  36.86 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  37.65 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  36.86 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  36.86 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_3031  high-affinity nickel-transporter  36.08 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  32.11 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  32.11 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  32.11 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1234  high-affinity nickel-transporter  33.87 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  36.11 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_3041  high-affinity nickel-transporter  30.3 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.167253  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  33.59 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
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NC_010511  M446_2333  high-affinity nickel-transporter  44.56 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144614  normal  0.152273 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2976  high-affinity nickel-transporter  33.69 
 
 		 342 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  31.54 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  30.54 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_4249  high-affinity nickel-transporter  44.7 
 
 		 367 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  31.93 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
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NC_007963  Csal_3208  high-affinity nickel-transporter  32.25 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A1753  high-affinity nickel-transporter  36.51 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1079  permease  27.89 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0887396  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I1976  putative nickel transporter  31.05 
 
 		 319 aa  96.3  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  32.99 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
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NC_009952  Dshi_0753  high-affinity nickel-transporter  35.71 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000315045  normal  0.331019 
 
 
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NC_009802  CCC13826_1792  tRNA pseudouridine synthase B  28.44 
 
 		 497 aa  76.3  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  23.94 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_1929  high-affinity nickel-transporter  31.75 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  27.03 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  29.34 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
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NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  27.39 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
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NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  27.71 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  27.27 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1737  high-affinity nickel-transporter  47.56 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284781  normal  1 
 
 
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NC_009715  CCV52592_0096  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  25.98 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00355357  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  25.58 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
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NC_008607  Ppro_3677  high-affinity nickel-transporter  25.7 
 
 		 207 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.841534  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  26.91 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  23.57 
 
 		 236 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
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NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  26.55 
 
 		 447 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  20.92 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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