52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Wp5SC on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  Wp5SC  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  220  6e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.709549  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0011  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0039  5S ribosomal RNA  94.74 
 
 		 115 bp  60  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna55  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0884571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0007  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00219563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0013  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.149045  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0007  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.951123  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0013  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.118637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna48  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0243319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0006  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000380355  hitchhiker  0.00390757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0011  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.712208  hitchhiker  0.00122523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0012  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00125226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0081  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.258574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0086  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919882  normal  0.263092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0008  5S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.488687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0013  23S ribosomal RNA  92.11 
 
 		 117 bp  52  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607574 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0262  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 119 bp  52  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1082  5S ribosomal RNA  87.04 
 
 		 119 bp  52  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.769106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SB  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.729876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc5SA  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0023  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 120 bp  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0014  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.873356  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0046  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.181249  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0026  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0051  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0040  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000114332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0035  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0007  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0282377  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0020  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0058  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000857994  normal  0.747107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0049  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.872613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0055  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0082  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0061  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0044  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0094  5S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0005  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.751826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0012  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0027  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0079  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0560482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0163  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0157  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884697  normal  0.0459109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0151  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.325051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0146  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.163233  hitchhiker  0.000349999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0141  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0130  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360206  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0095  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0012  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.486509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0009  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0003  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 115 bp  44.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0009  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845766  hitchhiker  0.000000221219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0006  5S ribosomal RNA  91.18 
 
 		 116 bp  44.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.166515  hitchhiker  0.0000000146471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>