32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2054 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2054  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.295818  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1388  putative transcriptional regulator  88.42 
 
 		 111 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.682529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2492  putative transcriptional regulator  82.18 
 
 		 101 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3145  putative transcriptional regulator  82.18 
 
 		 101 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5059  putative transcriptional regulator  82.18 
 
 		 101 aa  180  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3120  putative transcriptional regulator  78 
 
 		 107 aa  169  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0075021  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1972  putative transcriptional regulator  75.25 
 
 		 103 aa  161  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000001755  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  74.26 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1528  putative transcriptional regulator  74 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  35.87 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  32.63 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  27.72 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  40.79 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  32.61 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  32.88 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  28 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  31.25 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  34.94 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  27 
 
 		 130 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>