133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0729 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0729  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  187  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0711  hypothetical protein  96.74 
 
 
92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0129  hypothetical protein  96 
 
 
72 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2930  transposase IS4 family protein  46.67 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0753  ISEc4, transposase  46.67 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  48 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2949  transposase IS4 family protein  46.67 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.146429  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  46.67 
 
 
378 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  46.67 
 
 
378 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  46.67 
 
 
378 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1544  ISEc1, transposase  46.67 
 
 
263 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.59802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  46.67 
 
 
378 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  46.67 
 
 
378 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  46.67 
 
 
378 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  46.67 
 
 
378 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  45.33 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  45.33 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  47.22 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  47.22 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  47.22 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  45.83 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2196  transposase IS4 family protein  45.33 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398204  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  45.33 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01418  hypothetical protein  44 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  45.33 
 
 
378 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  45.83 
 
 
374 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0751  ISEc2, transposase  46.67 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000185341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  45.33 
 
 
378 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0730  ISEc2, transposase  46.67 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01430  hypothetical protein  44 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 
388 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 
388 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 
388 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 
388 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  41.98 
 
 
393 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 
388 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 
388 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  42.68 
 
 
388 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  46.67 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00666  hypothetical protein  44 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00655  hypothetical protein  44 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  43.42 
 
 
390 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  45.33 
 
 
377 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01416  hypothetical protein  42.11 
 
 
248 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01428  hypothetical protein  42.11 
 
 
248 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  40 
 
 
381 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  40 
 
 
381 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  40 
 
 
381 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
366 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0779  IS4 family transposase  36.9 
 
 
381 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.44414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1672  IS4 family transposase  36.9 
 
 
381 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.56828  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1741  IS4 family transposase  36.9 
 
 
381 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  36.11 
 
 
367 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3482  transposase, IS4 family protein  52.17 
 
 
327 aa  60.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.249116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0818  hypothetical protein  36.49 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3606  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4172  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4106  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4396  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  34.67 
 
 
373 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
369 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>