47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0129 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0129  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  146  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0711  hypothetical protein  96 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0729  hypothetical protein  96 
 
 		 92 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0753  ISEc4, transposase  47.73 
 
 		 253 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135748  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2930  transposase IS4 family protein  47.73 
 
 		 253 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  47.73 
 
 		 378 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  47.73 
 
 		 378 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1544  ISEc1, transposase  47.73 
 
 		 263 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.59802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  47.73 
 
 		 378 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  47.73 
 
 		 378 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  47.73 
 
 		 378 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2949  transposase IS4 family protein  47.73 
 
 		 253 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.146429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  47.73 
 
 		 378 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  47.73 
 
 		 378 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  47.73 
 
 		 378 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2196  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 		 263 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  45.45 
 
 		 378 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 		 378 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  45.45 
 
 		 378 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0751  ISEc2, transposase  47.73 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000185341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  45.45 
 
 		 378 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0730  ISEc2, transposase  47.73 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  47.73 
 
 		 377 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  47.73 
 
 		 377 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01430  hypothetical protein  43.18 
 
 		 258 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  46.34 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  46.34 
 
 		 374 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 		 378 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01418  hypothetical protein  43.18 
 
 		 263 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  46.34 
 
 		 230 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  46.34 
 
 		 374 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  46.34 
 
 		 374 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00655  hypothetical protein  43.18 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4179  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0621  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1183  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0626  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0292  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1656  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.882664  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0550  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00666  hypothetical protein  43.18 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  38.78 
 
 		 367 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  42.86 
 
 		 393 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>