126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0818 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0818  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  226  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01430  hypothetical protein  39.02 
 
 
258 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01418  hypothetical protein  39.02 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0751  ISEc2, transposase  39.19 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000185341  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1544  ISEc1, transposase  36.59 
 
 
263 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.59802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0730  ISEc2, transposase  39.19 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  37.8 
 
 
378 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  36.59 
 
 
378 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  36.59 
 
 
378 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2949  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 
253 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.146429  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  36.59 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  36.59 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  36.59 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  36.59 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2196  transposase IS4 family protein  35.37 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398204  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  36.59 
 
 
378 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2930  transposase IS4 family protein  35.37 
 
 
253 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0753  ISEc4, transposase  35.37 
 
 
253 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  34.15 
 
 
377 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  34.15 
 
 
378 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  34.15 
 
 
377 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00666  hypothetical protein  34.15 
 
 
253 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00655  hypothetical protein  34.15 
 
 
253 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0711  hypothetical protein  37.84 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.74132  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  35.14 
 
 
390 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01416  hypothetical protein  35.14 
 
 
248 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01428  hypothetical protein  35.14 
 
 
248 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0729  hypothetical protein  36.49 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2042  transposase, IS4 family protein  32.43 
 
 
230 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  normal  0.19233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  32.43 
 
 
374 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4172  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4396  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3592  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3606  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4106  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
369 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  32.43 
 
 
374 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  32.43 
 
 
374 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  32.43 
 
 
374 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  34.29 
 
 
367 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2994  transposase (IS4)  35.71 
 
 
212 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486834  normal  0.519471 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  31.34 
 
 
393 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
381 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
381 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
381 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0594  hypothetical protein  32.86 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.761756 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0195  IS1548 transposase  34.43 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0693  IS1548 transposase  34.43 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235647  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0760  IS1548 transposase  34.43 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0522474  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0945  IS1548 transposase  34.43 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00403728  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1584  IS1548 transposase  34.43 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1619  IS1548 transposase  34.43 
 
 
377 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1127  transposase, IS4  33.78 
 
 
290 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5649  transposase ISAs1 family protein  33.8 
 
 
377 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345672 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5630  transposase ISAs1 family protein  33.8 
 
 
377 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000338804 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5401  transposase ISAs1 family protein  33.8 
 
 
377 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5832  transposase ISAs1 family protein  33.8 
 
 
377 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0779  IS4 family transposase  30.99 
 
 
381 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.44414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1672  IS4 family transposase  30.99 
 
 
381 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.56828  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1741  IS4 family transposase  30.99 
 
 
381 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5802  transposase ISAs1 family protein  33.8 
 
 
377 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3911  transposase ISAs1 family protein  33.8 
 
 
377 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5528  transposase ISAs1 family protein  33.8 
 
 
377 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0898729 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  33.78 
 
 
374 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1172  transposase, IS4  33.78 
 
 
374 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>