More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5806 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3468  anthranilate synthase, component II  50.14 
 
 		 714 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.03 
 
 		 732 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  49.21 
 
 		 731 aa  680    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1366  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.07 
 
 		 762 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0518359 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 		 732 aa  1494    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  48.81 
 
 		 703 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1044  para-aminobenzoate synthase, component I  48.03 
 
 		 704 aa  602  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.869303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0951  para-aminobenzoate synthase, component I  47.19 
 
 		 705 aa  595  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.754558  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1666  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.87 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2111  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.49 
 
 		 687 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0378177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.51 
 
 		 718 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5650  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.63 
 
 		 672 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  47.2 
 
 		 686 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3391  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.76 
 
 		 637 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42151  predicted protein  42.01 
 
 		 760 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.062393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.04 
 
 		 721 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1828  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.42 
 
 		 518 aa  323  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.25 
 
 		 719 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  39.88 
 
 		 682 aa  296  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06300  aminodeoxychorismate synthase, component I  43.63 
 
 		 527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0721872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.7 
 
 		 466 aa  276  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.56 
 
 		 466 aa  264  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  36.39 
 
 		 465 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  36.14 
 
 		 465 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  35.05 
 
 		 465 aa  262  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06550  para aminobenzoic acid synthetase (Eurofung)  28.11 
 
 		 823 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0798538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  35.82 
 
 		 465 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  35.19 
 
 		 480 aa  259  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  40.3 
 
 		 408 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  34.95 
 
 		 465 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  34.95 
 
 		 465 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  34.95 
 
 		 465 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  34.19 
 
 		 465 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  34.95 
 
 		 465 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  34.95 
 
 		 465 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.47 
 
 		 471 aa  254  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  37.98 
 
 		 468 aa  253  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  35.89 
 
 		 495 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.03 
 
 		 460 aa  250  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.83 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  36.67 
 
 		 491 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  35.94 
 
 		 491 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  39.29 
 
 		 453 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  36.14 
 
 		 491 aa  247  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  33.19 
 
 		 494 aa  247  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  39.15 
 
 		 430 aa  246  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  39.15 
 
 		 430 aa  245  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  35.82 
 
 		 491 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.25 
 
 		 480 aa  244  6e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  37.81 
 
 		 462 aa  243  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.2 
 
 		 447 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  42.33 
 
 		 443 aa  243  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.81 
 
 		 480 aa  243  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  36.1 
 
 		 491 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  39.26 
 
 		 447 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.68 
 
 		 446 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.21 
 
 		 447 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4527  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  37.88 
 
 		 437 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.03 
 
 		 482 aa  240  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  37.08 
 
 		 489 aa  240  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.3 
 
 		 493 aa  240  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.16 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.42 
 
 		 461 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0376  anthranilate synthase component I  35.27 
 
 		 493 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957074  normal  0.0417216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.53 
 
 		 464 aa  239  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.71 
 
 		 457 aa  238  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.15 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.11 
 
 		 466 aa  238  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1272  para-aminobenzoate synthase, component I  33.48 
 
 		 448 aa  238  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.94 
 
 		 450 aa  237  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1094  para-aminobenzoate synthase, component I  33.48 
 
 		 448 aa  237  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0293848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.03 
 
 		 447 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  35.96 
 
 		 503 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  37.73 
 
 		 497 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  35.14 
 
 		 491 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  37.6 
 
 		 496 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  32.99 
 
 		 496 aa  234  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0506  anthranilate synthase component I  36.36 
 
 		 505 aa  233  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  31.75 
 
 		 475 aa  233  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.93 
 
 		 509 aa  232  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  34.64 
 
 		 494 aa  232  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.26 
 
 		 454 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.26 
 
 		 454 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1144  anthranilate synthase component I  32.29 
 
 		 472 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000269912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1291  anthranilate synthase component I  32.81 
 
 		 472 aa  231  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  39.26 
 
 		 454 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.37 
 
 		 460 aa  230  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1137  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.05 
 
 		 476 aa  230  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.174  normal  0.645122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  35.76 
 
 		 447 aa  230  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  35.37 
 
 		 458 aa  230  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  34.03 
 
 		 485 aa  230  9e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  35.37 
 
 		 458 aa  230  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  33.04 
 
 		 491 aa  230  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.37 
 
 		 458 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2940  anthranilate synthase component I  36.6 
 
 		 471 aa  229  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.256099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  38.99 
 
 		 454 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1342  anthranilate synthase, component I  37.56 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00981315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  34.14 
 
 		 474 aa  229  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2881  anthranilate synthase component I  33.41 
 
 		 509 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2351  chorismate binding-like protein  33.41 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181309  normal  0.0708866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>