More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5485 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5485  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
152 aa  313  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4377  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.82 
 
 
167 aa  194  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5153  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  61.39 
 
 
158 aa  190  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.7 
 
 
157 aa  170  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  56.16 
 
 
151 aa  166  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.16 
 
 
151 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.16 
 
 
151 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  56.16 
 
 
151 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  56.16 
 
 
156 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.16 
 
 
151 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.16 
 
 
151 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  56.16 
 
 
151 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.61 
 
 
171 aa  165  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.9 
 
 
163 aa  165  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  53.79 
 
 
149 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  53.38 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.56 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.42 
 
 
157 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  57.43 
 
 
155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  55.48 
 
 
151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.48 
 
 
151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  51.01 
 
 
155 aa  160  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.33 
 
 
188 aa  160  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.79 
 
 
151 aa  159  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4893  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.79 
 
 
148 aa  159  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4819  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.33 
 
 
151 aa  159  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  51.3 
 
 
153 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.79 
 
 
151 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.11 
 
 
151 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.48 
 
 
153 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4125  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.58 
 
 
154 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2111  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.64 
 
 
146 aa  158  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.3 
 
 
151 aa  158  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.48 
 
 
153 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.67 
 
 
163 aa  157  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.67 
 
 
158 aa  157  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  54.11 
 
 
154 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.08 
 
 
157 aa  157  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3840  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.72 
 
 
167 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1750  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.67 
 
 
151 aa  157  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  53.79 
 
 
153 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52 
 
 
153 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  53.79 
 
 
154 aa  157  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.79 
 
 
153 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.17 
 
 
146 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0838259  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.79 
 
 
153 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4836  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.3 
 
 
153 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  53.79 
 
 
153 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3530  (2Fe-2S)-binding  51.3 
 
 
153 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.31 
 
 
146 aa  155  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.65 
 
 
154 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3776  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.74 
 
 
152 aa  155  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1037  (2Fe-2S)-binding  53.06 
 
 
179 aa  156  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.365772  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  50 
 
 
152 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5448  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.65 
 
 
153 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0179621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0068  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.16 
 
 
167 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2575  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52 
 
 
151 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26060  oxidoreductase iron sulphur binding subunit  53.1 
 
 
152 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.98 
 
 
155 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.73 
 
 
159 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.75 
 
 
187 aa  154  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
162 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0849  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.11 
 
 
151 aa  154  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369182  normal  0.586703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  51.95 
 
 
155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0014  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.4 
 
 
151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.652545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.65 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  51.66 
 
 
163 aa  154  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6324  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.38 
 
 
156 aa  153  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.633542  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.79 
 
 
164 aa  153  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  55.17 
 
 
152 aa  153  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6069  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.06 
 
 
159 aa  153  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
155 aa  153  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
151 aa  153  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  51.68 
 
 
153 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  51.02 
 
 
153 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  51.68 
 
 
153 aa  152  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  51.68 
 
 
153 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  51.68 
 
 
153 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1703  (2Fe-2S)-binding protein  51.35 
 
 
167 aa  153  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281289  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6628  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.03 
 
 
153 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
153 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211012  normal  0.305671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7868  putative aldehyde dehydrogenase  49.02 
 
 
162 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  52.41 
 
 
153 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  51.68 
 
 
153 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  51.68 
 
 
153 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  51.68 
 
 
153 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.32 
 
 
155 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0913  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.42 
 
 
151 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2198  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
177 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185555  hitchhiker  0.00320999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.67 
 
 
151 aa  152  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0874  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.42 
 
 
151 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.36 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  50.68 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4569  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.79 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  51.7 
 
 
151 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0231  (2Fe-2S)-binding  48.98 
 
 
152 aa  151  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1768  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.8 
 
 
155 aa  150  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329121 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0864  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.02 
 
 
152 aa  151  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.383234 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0177  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.26 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0550651  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2616  putative isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  52.38 
 
 
153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>