20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4829 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4829    100 
 
 		 489 bp  969    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.271386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  88.46 
 
 		 1548 bp  111  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 1539 bp  103  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  85.71 
 
 		 1539 bp  89.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7463    84.03 
 
 		 1539 bp  85.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  93.22 
 
 		 1539 bp  85.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4274    88.31 
 
 		 1540 bp  81.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5987    92.16 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  86.49 
 
 		 1602 bp  67.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  94.74 
 
 		 1389 bp  60  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  84.42 
 
 		 1533 bp  58  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  86.67 
 
 		 1569 bp  56  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  86.67 
 
 		 1284 bp  56  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  86.44 
 
 		 1539 bp  54  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  86.44 
 
 		 1539 bp  54  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  86.44 
 
 		 1539 bp  54  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  83.54 
 
 		 1542 bp  54  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1742    89.13 
 
 		 1556 bp  52  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.812145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1167    94.12 
 
 		 225 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  84.75 
 
 		 1539 bp  46.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>