More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3744 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  52.19 
 
 		 3470 aa  1003    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  40.75 
 
 		 2628 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  43.36 
 
 		 2174 aa  758    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  47.74 
 
 		 4317 aa  875    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  47.73 
 
 		 5953 aa  870    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  48.22 
 
 		 6889 aa  882    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  40.47 
 
 		 5620 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  47.65 
 
 		 4336 aa  962    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  43.9 
 
 		 1104 aa  732    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  37.84 
 
 		 2625 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  50.85 
 
 		 2151 aa  1025    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  44.95 
 
 		 2875 aa  776    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  42.38 
 
 		 5929 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  43.27 
 
 		 1753 aa  799    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  43.43 
 
 		 3432 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  44.98 
 
 		 4531 aa  829    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.96 
 
 		 2385 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  36.05 
 
 		 2385 aa  641    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  35.87 
 
 		 2385 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1180  non-ribosomal peptide synthetase, putative  42.47 
 
 		 1732 aa  683    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  40.3 
 
 		 3328 aa  656    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  43.1 
 
 		 2125 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  41.69 
 
 		 3021 aa  710    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  40.31 
 
 		 1370 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  48.29 
 
 		 4336 aa  957    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  43.22 
 
 		 1136 aa  725    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  43.4 
 
 		 2370 aa  730    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  51.27 
 
 		 2154 aa  1019    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  46.28 
 
 		 2883 aa  790    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  41.4 
 
 		 6081 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  40.46 
 
 		 5926 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  41.26 
 
 		 9498 aa  688    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  40.62 
 
 		 5372 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  41.11 
 
 		 13537 aa  712    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  46.5 
 
 		 6676 aa  865    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  44.94 
 
 		 3348 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  38.3 
 
 		 2867 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  41.32 
 
 		 2791 aa  806    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  36.98 
 
 		 1142 aa  701    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  45.2 
 
 		 3308 aa  922    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  40.62 
 
 		 3498 aa  768    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  47.42 
 
 		 4317 aa  874    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  39.94 
 
 		 2033 aa  758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  37.73 
 
 		 1786 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  37 
 
 		 1093 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  47.57 
 
 		 8646 aa  864    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  50.88 
 
 		 5328 aa  979    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2088  pyoverdine synthetase D  42.11 
 
 		 1739 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.393572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  40.43 
 
 		 6006 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  40.54 
 
 		 6072 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  40.51 
 
 		 4572 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  44.94 
 
 		 3291 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  45.54 
 
 		 5654 aa  806    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  48.67 
 
 		 4502 aa  987    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  42.56 
 
 		 1383 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  37.58 
 
 		 3291 aa  710    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  44.84 
 
 		 4882 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  43.2 
 
 		 3002 aa  708    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  41.2 
 
 		 1369 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  47.69 
 
 		 4332 aa  931    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  42.62 
 
 		 4383 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  40.97 
 
 		 1405 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.96 
 
 		 2385 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  49.55 
 
 		 4037 aa  1013    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  50.58 
 
 		 1138 aa  1034    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  47.13 
 
 		 1801 aa  928    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  40.41 
 
 		 4468 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  38.69 
 
 		 1104 aa  636    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1928  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  42.32 
 
 		 1745 aa  683    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  41.27 
 
 		 5467 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  43.9 
 
 		 4489 aa  716    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  33.75 
 
 		 1833 aa  655    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  39.2 
 
 		 2187 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  51.27 
 
 		 3432 aa  1014    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  48.32 
 
 		 4342 aa  927    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  41.22 
 
 		 1675 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  45.47 
 
 		 1129 aa  827    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  46.96 
 
 		 4991 aa  833    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  42.51 
 
 		 8914 aa  693    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2785  amino acid adenylation domain-containing protein  41.35 
 
 		 1370 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.178611 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  42.1 
 
 		 8915 aa  684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  45.23 
 
 		 3176 aa  826    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.44 
 
 		 4478 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  48.59 
 
 		 4342 aa  928    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  52.42 
 
 		 5149 aa  1008    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  46.64 
 
 		 2189 aa  819    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  44.71 
 
 		 2448 aa  842    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  52.42 
 
 		 4136 aa  1005    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  36.75 
 
 		 2386 aa  638    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  41.38 
 
 		 7785 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1943  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  42.38 
 
 		 1741 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  46.98 
 
 		 2651 aa  789    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  57.58 
 
 		 1130 aa  1165    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  49.72 
 
 		 1779 aa  912    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  45.19 
 
 		 5230 aa  778    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  40.34 
 
 		 1528 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1624  putative non-ribosomal peptide synthetase  42.18 
 
 		 1732 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0874  putative non-ribosomal peptide synthetase  42.47 
 
 		 1732 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  43.43 
 
 		 2350 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  40.3 
 
 		 3352 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>