53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0191 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 		 395 aa  786    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  70.33 
 
 		 392 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  65.19 
 
 		 399 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  62.28 
 
 		 394 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  60.41 
 
 		 390 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  60.45 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  63.23 
 
 		 386 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  62.96 
 
 		 386 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  57.04 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  59.9 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  59.75 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  60.87 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  61.24 
 
 		 391 aa  448  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  59.49 
 
 		 405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  59.14 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  60.62 
 
 		 400 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  60.31 
 
 		 388 aa  441  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  59.14 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  58.84 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  58.94 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  59.18 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  59.15 
 
 		 378 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  58.67 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.67 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  58.14 
 
 		 378 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  56.63 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  55.61 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  56.35 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  54.55 
 
 		 380 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  54.29 
 
 		 380 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  54.29 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  55.84 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  55.84 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  56.09 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  57.36 
 
 		 383 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  56.3 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  52.55 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  71 
 
 		 242 aa  335  9e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  68.18 
 
 		 228 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.3 
 
 		 281 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.41 
 
 		 272 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.83 
 
 		 291 aa  92.8  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  31.96 
 
 		 277 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.99 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.59 
 
 		 278 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.42 
 
 		 288 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.13 
 
 		 290 aa  89.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.07 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.18 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.8 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.47 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2542  hypothetical protein  31.34 
 
 		 308 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>