18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1775 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1775  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0870  putative lipoprotein  60.98 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000878798  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003105  ubiquitin-protein ligase  58.88 
 
 		 326 aa  371  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000640015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02737  hypothetical protein  60.59 
 
 		 326 aa  371  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2704  hypothetical protein  47.75 
 
 		 487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.788848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3599  hypothetical protein  48.85 
 
 		 460 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.792051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1027  hypothetical protein  34.26 
 
 		 231 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1184  hypothetical protein  39.18 
 
 		 541 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.984742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2476  hypothetical protein  31.03 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.324767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0522  hypothetical protein  37.76 
 
 		 517 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0517  hypothetical protein  37.76 
 
 		 517 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0489  hypothetical protein  40.51 
 
 		 510 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 494 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0855  hypothetical protein  28.06 
 
 		 546 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3644  hypothetical protein  31.34 
 
 		 523 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3491  hypothetical protein  28.85 
 
 		 529 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3575  hypothetical protein  30.6 
 
 		 522 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3391  hypothetical protein  34.62 
 
 		 534 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000869188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>