48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06778 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  41.89 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  41.22 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  39.86 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  39.86 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  39.19 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  42.03 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  40.58 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  38.24 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  38.24 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  38.24 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  36.02 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  33.58 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  33.91 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  34.9 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  36.11 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  31.76 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  34.23 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  33.56 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  34.81 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  30.41 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  33.54 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  37.84 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  27.07 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  34.04 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  31.2 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  30.41 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  30.6 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  32.37 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  31.34 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  32.9 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  30.43 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  31.34 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  29.93 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  31.34 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  25.56 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  31.85 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  31.34 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  30.07 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  32.41 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  31.34 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  31.34 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  31.34 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1692  hypothetical protein  26.35 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  29.85 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  24.58 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 280 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>