54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01197 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01197  phosphatase/nucleotidase  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2694  phosphatase/nucleotidase  60 
 
 
711 aa  241  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0870  phosphatase/nucleotidase  37.5 
 
 
632 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0599439  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0351  5'-Nucleotidase domain protein  34.85 
 
 
579 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0600  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.67 
 
 
630 aa  64.3  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0113875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2550  hypothetical protein  25.13 
 
 
697 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017247  hitchhiker  0.000000000139716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2414  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.63 
 
 
648 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2261  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  25.63 
 
 
671 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0897144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.56 
 
 
549 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2536  hypothetical protein  24.62 
 
 
650 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.19344e-31 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3032  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.56 
 
 
550 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1207  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.09 
 
 
596 aa  55.1  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2743  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.62 
 
 
652 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0931599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1147  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.26 
 
 
551 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0136849  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2418  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.68 
 
 
724 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2304  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.62 
 
 
650 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.199314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.29 
 
 
549 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2341  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.66 
 
 
527 aa  51.6  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00445033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7607  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  27.22 
 
 
585 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3393  5'-nucleotidase; 2',3'-cyclic phosphodiesterase  36.05 
 
 
527 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.803597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.68 
 
 
1284 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3724  2,3-cyclic-nucleotide 2-phosphodiesterase, putative  33.33 
 
 
529 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3747  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  33.33 
 
 
527 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0108309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3796  5'-nucleotidase family protein  24.72 
 
 
527 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  34.88 
 
 
527 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1027  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.65 
 
 
550 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3476  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase, N-terminus  33.72 
 
 
320 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3705  5'-nucleotidase family protein  33.72 
 
 
527 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000001284 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2288  5'-nucleotidase family protein  28.97 
 
 
511 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000276181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1751  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.84 
 
 
553 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000978587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4198  5'-Nucleotidase domain protein  22.68 
 
 
631 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1992  putative 2`,3`-cyclic-nucleotide 2`-phosphodiesterase  23.5 
 
 
634 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4481  5'-Nucleotidase domain protein  22.16 
 
 
631 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  30.67 
 
 
633 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3032  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.8 
 
 
551 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0289029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2342  5'-nucleotidase  37.14 
 
 
264 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.395983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0415  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.84 
 
 
550 aa  45.1  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0800  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.6 
 
 
553 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  27.91 
 
 
590 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3374  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.56 
 
 
527 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0557  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.22 
 
 
550 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2752  5'-Nucleotidase domain protein  23.58 
 
 
613 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0323824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00431  UDP-sugar hydrolase  22.22 
 
 
550 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.373208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004198  5'-nucleotidase  23.08 
 
 
560 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00436  hypothetical protein  22.22 
 
 
550 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3136  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.22 
 
 
550 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161033  unclonable  0.0000000215982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0519  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.22 
 
 
550 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3130  5'-Nucleotidase domain protein  22.22 
 
 
550 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.520535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0572  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.22 
 
 
550 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0524  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.22 
 
 
550 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1792  5'-Nucleotidase domain protein  23.71 
 
 
549 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.96208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1519  5'-nucleotidase family protein  32.65 
 
 
527 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.672653  normal  0.132141 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01256  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.08 
 
 
553 aa  41.6  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4699  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.32 
 
 
616 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>