18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00669 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  689    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  58.61 
 
 
335 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  48.61 
 
 
329 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  48.61 
 
 
329 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  35.6 
 
 
342 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  33.1 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  29.96 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  29.03 
 
 
352 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  29.08 
 
 
354 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4854  hypothetical protein  27.76 
 
 
355 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  26.71 
 
 
377 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  29.71 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  26.71 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  23.71 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  25.93 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  27.99 
 
 
350 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  25.36 
 
 
293 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2357  hypothetical protein  22.51 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>