42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003261 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  100 
 
 
85 aa  173  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  96.47 
 
 
85 aa  167  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  92.94 
 
 
85 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  92.94 
 
 
85 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  91.76 
 
 
85 aa  163  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1782  prevent-host-death family protein  94.12 
 
 
85 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  90.59 
 
 
85 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0542  hypothetical phage-related protein  76.19 
 
 
84 aa  140  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  74.12 
 
 
85 aa  137  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  64.71 
 
 
85 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  57.65 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  60.53 
 
 
76 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  40 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  40 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  37.35 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  33.73 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  40.32 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  28.92 
 
 
93 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  37.7 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  33.75 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  30 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  26.92 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  34.33 
 
 
91 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  29.33 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  29.33 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  28.24 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  27.94 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  33.73 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  26.83 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  32.88 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  27.94 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  27.78 
 
 
94 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  23.75 
 
 
95 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1467  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  28.74 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  34.29 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2131  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.905703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0411  prevent-host-death family protein  30.43 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0478215  normal  0.130855 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0125  addiction module antitoxin  28 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17666e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>