32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003033 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003033  tetrathionate reductase subunit C  100 
 
 		 376 aa  743    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  36.58 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3678  Polysulphide reductase NrfD  36.36 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0590  polysulphide reductase NrfD  35.92 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  35.92 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0663  polysulphide reductase, NrfD  36.49 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  35.56 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3735  polysulphide reductase NrfD  36.39 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  35.37 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1481  tetrathionate reductase complex subunit C  34.45 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1787  tetrathionate reductase complex, subunit C  34.17 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1958  tetrathionate reductase complex, subunit C  33.98 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  hitchhiker  0.000000744183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1518  tetrathionate reductase complex subunit C  34.17 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000105218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1497  tetrathionate reductase complex, subunit C  33.8 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000345555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  35.11 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1068  polysulphide reductase NrfD  34.79 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  33.43 
 
 		 361 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  35.28 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0898  tetrathionate reductase, subunit C  33.33 
 
 		 342 aa  129  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.392425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.96 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  24.73 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  25.95 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  28.88 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  22.79 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  23.4 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  23.05 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  24.26 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  30.77 
 
 		 330 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  30.47 
 
 		 331 aa  46.6  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  31.25 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  30.56 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  29.57 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>