28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000860 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000860  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000138514  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06835  hypothetical protein  97.99 
 
 
199 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1778  hypothetical protein  75.13 
 
 
198 aa  315  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.459954  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0182  hypothetical protein  72.22 
 
 
205 aa  313  8e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1812  hypothetical protein  70.71 
 
 
198 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00771142  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2654  hypothetical protein  70.71 
 
 
198 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2539  hypothetical protein  70.71 
 
 
198 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2532  hypothetical protein  70.2 
 
 
198 aa  294  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0907  hypothetical protein  28.28 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1447  hypothetical protein  28.5 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353847  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0918  protein of unknown function DUF358  25.14 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000434231  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1107  hypothetical protein  27.55 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3229  hypothetical protein  27.92 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000502715  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1566  hypothetical protein  27.86 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.675454  hitchhiker  0.00439427 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0609  hypothetical protein  28.14 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0735  protein of unknown function DUF358  26.47 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0171  hypothetical protein  24.62 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.190358  normal  0.933799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1876  hypothetical protein  28.28 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205093 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1588  hypothetical protein  24.4 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00408937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1963  hypothetical protein  26.5 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0731  hypothetical protein  23.12 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.336545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0545  hypothetical protein  27.14 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0274885  normal  0.338347 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0217  hypothetical protein  22.89 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.638507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3024  hypothetical protein  26.13 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1731  hypothetical protein  24.12 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0669  hypothetical protein  22.66 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.239778  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2697  protein of unknown function DUF358  26 
 
 
199 aa  54.7  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0549  hypothetical protein  30.43 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>