14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0505 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0505  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000868793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  30.93 
 
 
297 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  29.93 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  29.67 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  24.37 
 
 
315 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3963  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0922  ribokinase-like domain-containing protein  24.29 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  28.77 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1200  PfkB domain protein  25.48 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.460127  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0398  ribokinase-like domain-containing protein  25.71 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.688788  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  22.36 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1734  ribokinase-like domain-containing protein  24.59 
 
 
281 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.264913  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1424  PfkB domain protein  25.1 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  34.41 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>